1957～59年に行われた発掘調査によって南大門、中門、塔、西金堂、中金堂、講堂、回廊などが検出された。伽藍配置の特色として、中金堂の前庭に塔と西金堂を対置することが挙げられ、このような配置形式をとる寺院として他に近江南滋賀廃寺や筑紫観世音寺などの例が考えられている。川原寺創建の事情は明らかでないが、創建以前の遺構によって埋め立てられた池に埋没していた遺物から７世紀前半を遡り得ないことが指摘されている。また、創建以前の遺構が発見されたことから、これらを川原宮と推定する考えがある。藤原宮期を通じて官の三大寺、四大寺に数えられる格式を保っていたが、鎌倉時代に焼失する。しかし、川原寺裏山遺跡の発掘によって、金箔が施されたものも含めて、千数百点の三尊塼仏、数百点の塑像などが出土し、創建当初の堂塔内の華麗さを伺い知ることができるようになった｡現在伽藍の一部が復元整備されており、当時の面影を偲ぶことができる。

　我が国における代表的な方墳である。墳丘の盛土が全く残っておらず、巨大な両袖式の横穴式石室が露出している。天井石の上面が広く平らなため、古くからこの名称がついている。被葬者は明らかではないが、７世紀初頭に権力を握っていた蘇我馬子の墓ではないかと言われている。1933～35年の発掘調査によって方形の墳丘、堀、外堤が存在すること、６世紀代の小古墳を壊して築造されていたことなどが確認されており、築造は７世紀初め頃と推定されている。周辺一帯は、国営公園となっている。

　飛鳥地方を貫流して大和川にそそぐ美しい川。現在は川幅が狭くなっているが、古代には水量も豊かで流れが激しく、しばしば氾濫しては飛鳥人を悩ませていた。しかし人々は、この川のすべての風物を愛し、日常の生活感情と結びつけては歌に詠んでいた。それらの歌は万葉集の中に数多く残されている。

　大字稲渕から栢森にかけての飛鳥川沿には、南淵請安の墓とされる石碑（写真左中央）や飛鳥川の飛石と呼ばれる石、美しい棚田の風景が存在する。南淵請安は推古天皇六（608）年、遣隋使小野妹子らとともに隋に渡った留学生のうちのひとりで、大化の改新を計画した中大兄皇子と中臣鎌足に大陸の新しい様々な知識などを伝授したとされる渡来系漢人である｡神明塚という小さな丘にある、寛文二（1662）年建立の"南淵先生之墓"と刻まれた石碑が建つ場所を一般的に南淵請安の墓としている｡この川に沿って稲淵、栢森を通り芋峠へと続き、吉野へと抜ける道が存在したと考えられており、持統天皇のたび重なる吉野行幸にはルートの一つとしてこの川沿いの道も想定されている。

　1959年からの発掘調査により、多くの掘立柱建物、掘立柱塀、石組溝、石敷遺構などが検出された。その遺構の変遷は、大きく三時期に分類され、それぞれ、飛鳥岡本宮、飛鳥板蓋宮、後飛鳥岡本宮・飛鳥浄御原宮であったことから、支配体制の変革や王権の存在形態、その歴史的変遷を考えるうえで重要である。また、飛鳥板蓋宮は、中大兄皇子・中臣鎌足が大化改新を断行し、蘇我入鹿を倒したといわれる場所でもある。現在は地表上に当時の遺構を復元、整備されている。

　石造物のうちの一つで、平坦な表面に液の溜まりと溝様の彫り込みがある。酒を搾ったものであろうとの想像からこの名前がついたが、油を造ったものであろうとか、庭園の施設の一部であろうとか諸説ある。この石はもともと大きかったものが、近世にはいって高取城を築城する際に大きく割って搬出されたのではないかとの言い伝えがある。近年の発掘調査によって、酒船石のある丘陵は、裾部に花崗岩を据え、頂部に天理市の石上付近で産出する砂岩の切石を積み上げた「石垣」で取り囲まれていたことが数次にわたる発掘調査によって明らかとなってきた。これらの事柄は『日本書紀』にある「宮の東の山に石を累ねて垣とする」「石の山丘を作る」、石を「石上山」から運んだとする、などの記述をあらわしていると思われる。

　酒船石遺跡の北西に位置する謎の石造物。1999年発見された。全長2.4ｍ、幅２ｍの亀形を呈する。顔を南向きにして据えられていた。丸く彫られた両目、４本の指の表現が施された両足が特徴的である。甲羅部分は円形の凹型になっており、水を溜める仕組みであったことがわかる。水は鼻の穴から甲羅部分に流れ込み、V字状に彫り窪められ表現された尻尾の部分から流れ出すようになっている。亀形石槽のすぐ南側には小判形（船形）に彫り込まれた水槽を有する石造物が、さらに南側にこれら石造物に水を供給していたと思われる湧水施設がみつかっている。斉明天皇が信仰した道教の世界を表す両槻宮の一部ではないかとか、政治を占う施設とか、身を浄める場所とかさまざまな説がある。出土した土器などから７世紀中頃～10世紀の間にかけて利用されていたことが確認されている。

　義淵僧正によって建立されたと伝えられるが、当時のものは隣接する治田神社境内にあったと考えられている。　
　重文の仁王門・書院をはじめ、本堂・楼門（桃山時代1614）など堂宇の美しい寺院で、義淵僧正坐像（国宝、奈良末～平安初期）・天人浮刻塼（重文・奈良時代８世紀）・木造仏涅槃像（重文・藤原時代）の他、本尊の如意輪観音坐像（重文・天平）は我国最大の塑像として有名である。なお、胎内仏という奈良前期の銅造如意輪観音像がある。また観音信仰の対象として、西国33カ所巡りの７番札所となっているため常に多くの参詣者がある。開山の義淵僧正は８世紀に活躍する一流の名僧たちを育成した人として有名である。

　588年蘇我馬子の発願によって建立されたと伝えられる日本最古の仏教寺院。この造営には百済から渡来した僧・寺工など、多くの新知識や技術を携えた人々がかかわった。1956年からの発掘調査によって､塔を中心に東・西・北に金堂を築き、中門からのびる回廊がこれらを取り囲む伽藍配置であることが明らかとなった。日本に類例のないこの配置は、高句麗の清岩里廃寺に近似していることが指摘されている。また、"飛鳥大仏"の名で親しまれている本尊の釈迦如来は、止利仏師の作といわれているが、中国北魏様式をとっており、当寺が東アジアの様々な要素を取り込んで造営されていることがわかる。1196年の火災によって大破したが、法隆寺金堂釈迦三尊像との類似が指摘されている。

　甘樫丘の東側、飛鳥寺の西側に位置する。発掘調査の結果、特異な基壇を持つ大形の正方形建物遺構が見つかった。発見された遺構は他に、基壇内を走る木樋暗渠、銅管､漆塗木箱などがある｡基壇内部に引き込んだ水を基壇上へ汲み上げる装置を持ち、中国に現存する元・明・清代の漏刻の受水槽と同様の漆塗木箱の痕跡が検出されていることなどから、これらの遺構は斉明天皇６年の時、皇太子であった中大兄皇子が作ったと伝えられる「漏刻」台の跡であることが想定されている｡「漏刻」台が築かれた背景として、当時の中国的な政治理念にもとづいた「時の支配」の観念が存在したことが考えられている。出土した土器の検討から650年～660年代の間に造営され廃絶したと推定されている。

　神道は、大陸伝来の仏教に対し、日本古来の信仰であるが、その信仰を現す神社は、大部分規模が小さく簡素質朴である。この神社は神託によって829年３月10日現在の地に鎮座し、この地最古のものと伝えられる。鬱蒼とした森の中にあって、神のおられる所という意味で呼ばれる"神奈備"の雰囲気がよく現わされている。（飛鳥における神奈備は大和三山や、栢森などがある）
　毎年２月の第一日曜日には天下の奇祭「おんだ祭り」が行われ五穀豊穣・子孫繁栄を祈願する参詣者でにぎわう。

　頂上からは飛鳥一円が眺望できる標高145mの小高い丘である。この丘の中腹と麓に、蘇我蝦夷・入鹿親子の邸があったと言われているが、大化改新によって入鹿が中大兄皇子に倒された直後、蝦夷はその邸に火をかけて自害したといわれている。『多武峯縁起絵巻』などにも炎上する蘇我邸が描かれているが、甘樫丘の東麓にあたる場所（甘樫丘東麓遺跡）が発掘された結果、焼けた建築部材・土器などが出土した。この位置が大化の改新の際中大兄皇子が陣取ったとされる飛鳥寺と対峙することや、土器の年代観が、この時期に一致することなどから、調査地の上方に蘇我邸が存在していたであろうことが想定されている。

　日本最初の女帝である推古天皇は592年に即位するが、崇峻天皇暗殺から間もない時であったため、新たに大規模な宮殿を築かなかったとする考えがあり、それが蘇我氏の邸宅の一部を転用した豊浦宮と考えられている。飛鳥時代の幕開けである｡その後、宮は豊浦寺となるが、発掘調査の結果、金堂・講堂など伽藍配置の一部が明らかとなっている。また、出土した瓦からは飛鳥寺との関係が深いことや、遠隔地からも供給されていたことなどが判明した。

　大化の改新の功臣蘇我倉山田石川麻呂によって発願されたとされる。その後謀反を企てたとする嫌疑により石川麻呂は自刃したが造営は続けられた。
　1976年から1996年度にかけて発掘調査が行われ、７世紀に創建された寺院のほぼ全容が明らかにされ、伽藍配置は中心部に塔、金堂を南北に並べて回廊で囲み、その北に講堂､講堂の北と東西に僧房などを配置していたことがわかる。1982年から始まった調査では、東回廊が横倒しの状態でほぼ完全な形で発見されたほか、出土遺物の中には、金箔を施した塼仏、彩色が施された垂木先瓦、垂木に固定する釘を隠すように取り付けられた金色のフタなどがあり、当時の華麗な寺の趣を伺い知ることができる。

　天武天皇の遺志を継いだ持統天皇が造営を再開した中国式の本格的都城で規模の壮大さは、それ以前の宮をはるかに凌ぐものであった。「新益京」ともいう｡持統天皇から文武天皇を経て、元明天皇が平城遷都するまでの16年間都であった。新しい都造営のため全国各地から役民が集められ、水運・陸運を使って近江などから木材が調達されたことが知られている。宮殿建築に瓦を葺くようになったのは藤原宮が初めてで、主要建物は堅固な基壇を有する礎石建ちの建物となった。京内には多くの貴族、役人が邸宅や居をかまえ、官営の市などが設けられていた｡大和三山が描く三角形の中心の地点にあることから、中央集権が確立された結果を物語るものと考えられる。